Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
Csnka2ipQ8CH19 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Csnka2ipQ8CH19 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms