Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Zbtb21-203ENSMUST00000113734 6010 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Tnnt3-212ENSMUST00000105950 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Tnnt3-224ENSMUST00000169299 1013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Tnnt3-226ENSMUST00000180152 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 AC154319.1-201ENSMUST00000216330 312 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ccdc28aQ8CEI3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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