Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Mfsd2b-201ENSMUST00000045921 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Erbin-201ENSMUST00000022222 6369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Ccdc148-204ENSMUST00000226455 4612 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Usp27Q8CEG8 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Usp27Q8CEG8 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Usp27Q8CEG8 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Il16-203ENSMUST00000145610 3183 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Usp27Q8CEG8 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Rd3-202ENSMUST00000180463 3724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
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Usp27Q8CEG8 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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Usp27Q8CEG8 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Mgme1-201ENSMUST00000028910 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp27Q8CEG8 Arsb-201ENSMUST00000091403 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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