Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Sept2-201ENSMUST00000027495 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Atg16l1Q8C0J2 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Rrm2b-201ENSMUST00000022901 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm14023-201ENSMUST00000144178 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Dido1-204ENSMUST00000103055 4613 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Pde2a-201ENSMUST00000163751 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ifi211-201ENSMUST00000009340 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Atg16l1Q8C0J2 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms