Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Spesp1-201ENSMUST00000056949 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Zw10-201ENSMUST00000034803 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Rpl4-201ENSMUST00000034966 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm11952-201ENSMUST00000121172 821 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ccser1Q8C0C4 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Adipoq-201ENSMUST00000023593 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Catsperz-201ENSMUST00000057716 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ccser1Q8C0C4 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ccser1Q8C0C4 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm17192-201ENSMUST00000169031 511 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Dydc1-203ENSMUST00000189865 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccser1Q8C0C4 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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