Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Pole-202ENSMUST00000112481 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 AC101205.2-201ENSMUST00000226206 715 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Rps9-201ENSMUST00000006496 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Tstd2-201ENSMUST00000107770 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Ttc1-201ENSMUST00000048578 1438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 3000002C10Rik-201ENSMUST00000125451 1614 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Trav10d-201ENSMUST00000103646 406 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Lyrm1-202ENSMUST00000106516 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Gm13857-201ENSMUST00000139645 173 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 CT010505.2-201ENSMUST00000227918 998 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Stpg4-201ENSMUST00000040609 847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Acsm1-201ENSMUST00000047929 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Cfi-201ENSMUST00000077918 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Slfn3-201ENSMUST00000019130 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Gad1-ps-201ENSMUST00000167243 1776 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Ap5s1-203ENSMUST00000110208 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssc5dQ8BV57 Gm5510-201ENSMUST00000117826 486 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms