Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Nfkbiz-202ENSMUST00000096026 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Csnk1g1-214ENSMUST00000206594 2482 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx52-201ENSMUST00000049257 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 CT868720.1-201ENSMUST00000223069 2544 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1121-202ENSMUST00000213792 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Col20a1-202ENSMUST00000149179 3867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Lrrtm2Q8BGA3 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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