Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Olfr209-202ENSMUST00000208246 428 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm25125-201ENSMUST00000083340 136 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Dnaja1-201ENSMUST00000030118 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Deup1-203ENSMUST00000115593 3019 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm43625-201ENSMUST00000199177 1539 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Fyttd1-211ENSMUST00000171325 4295 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Defb48-201ENSMUST00000100493 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Ighv14-3-201ENSMUST00000103469 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Rplp1-ps1-201ENSMUST00000119410 345 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Ptpa-210ENSMUST00000136009 810 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm15831-201ENSMUST00000156195 516 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 1700048F04Rik-201ENSMUST00000199057 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gimd1-205ENSMUST00000212852 1234 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm46210-201ENSMUST00000218800 577 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 AC242269.1-201ENSMUST00000227020 741 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Bcl11a-203ENSMUST00000109516 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm6727-201ENSMUST00000204102 1518 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Fgf1-203ENSMUST00000117566 418 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm16226-204ENSMUST00000162639 423 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 AY761184-201ENSMUST00000071886 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm38227-201ENSMUST00000193036 1602 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Cd74-203ENSMUST00000167610 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Blvra-202ENSMUST00000110389 657 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm5627-201ENSMUST00000178539 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 AC161052.1-201ENSMUST00000222856 910 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 AC166061.1-201ENSMUST00000225163 1138 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm14538-201ENSMUST00000122019 1327 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Pvalb-202ENSMUST00000120592 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Polr1c-203ENSMUST00000124655 829 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Faap24-203ENSMUST00000154597 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Ift22-204ENSMUST00000200153 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 AC164614.1-201ENSMUST00000216038 397 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 4930458K08Rik-201ENSMUST00000219952 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Cyp7b1-201ENSMUST00000035625 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NischQ80TM9 Gm3404-201ENSMUST00000110596 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm15587-202ENSMUST00000156403 709 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm28809-201ENSMUST00000187542 782 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm7812-201ENSMUST00000203479 874 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm18749-201ENSMUST00000222410 692 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 CT009550.1-201ENSMUST00000225750 864 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm26953-209ENSMUST00000213051 2087 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Adig-202ENSMUST00000109484 488 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NischQ80TM9 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
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