Protein–RNA interactions for Protein: Q60596

Xrcc1, DNA repair protein XRCC1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc1Q60596 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Asz1-201ENSMUST00000010940 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 AU020206-201ENSMUST00000181224 656 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm10752-201ENSMUST00000218348 729 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Pde4b-206ENSMUST00000106907 1374 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm16237-201ENSMUST00000156666 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm17244-201ENSMUST00000192482 3416 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Fscn3-201ENSMUST00000031719 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Xrcc1Q60596 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms