Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Sh3gl2-204ENSMUST00000107189 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Raver1-201ENSMUST00000115487 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm13328-201ENSMUST00000120816 1020 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Fbxl5-202ENSMUST00000087465 4237 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm37264-201ENSMUST00000194916 2192 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Slc23a2-201ENSMUST00000028815 6364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Sec31aQ3UPL0 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec31aQ3UPL0 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec31aQ3UPL0 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec31aQ3UPL0 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec31aQ3UPL0 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Sec31aQ3UPL0 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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