Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Atxn1l-201ENSMUST00000093162 7526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Rnf149Q3U2C5 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Hsdl1-204ENSMUST00000212517 2215 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Nr2f2-202ENSMUST00000089565 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 C030037D09Rik-203ENSMUST00000138007 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Atp6v0a4-202ENSMUST00000114908 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 A130010J15Rik-205ENSMUST00000178744 3782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gltp-202ENSMUST00000112212 799 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Rnf149Q3U2C5 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms