Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Mir598-201ENSMUST00000102094 79 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Scgb2b25-ps-201ENSMUST00000121936 307 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm16228-201ENSMUST00000162286 809 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm8768-201ENSMUST00000220020 826 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Fthl17e-201ENSMUST00000096509 841 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm17141-201ENSMUST00000167578 3148 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Srsf6Q3TWW8 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
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