Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Tmem181b-ps-201ENSMUST00000167717 1413 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm7255-201ENSMUST00000187371 908 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 AC154436.1-201ENSMUST00000227272 782 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 4930432L08Rik-201ENSMUST00000132154 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 4930571N24Rik-202ENSMUST00000142914 598 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 1110036E04Rik-201ENSMUST00000181151 777 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ctdnep1Q3TP92 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
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