Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Erg-208ENSMUST00000176345 1222 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s130-201ENSMUST00000178128 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm20773-202ENSMUST00000193306 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
Samd11Q1RNF8 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Gm26716-201ENSMUST00000181227 415 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Map1lc3b-205ENSMUST00000181948 766 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Kif4-ps-202ENSMUST00000185083 652 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Gm29543-201ENSMUST00000188138 967 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Gm28342-201ENSMUST00000190308 589 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Chac2-201ENSMUST00000020553 1018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 4933407I05Rik-202ENSMUST00000213467 420 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 AC163703.1-201ENSMUST00000214133 339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Lrp1-203ENSMUST00000121829 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Samd11Q1RNF8 Nup188-202ENSMUST00000113634 534 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms