Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm45210-201ENSMUST00000206401 1577 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm15719-201ENSMUST00000120619 635 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Rpusd2Q149F1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 D430013B06Rik-201ENSMUST00000192922 1872 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rpusd2Q149F1 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms