Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Slc44a4-202ENSMUST00000169230 2246 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm12056-201ENSMUST00000148364 1257 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm44605-201ENSMUST00000206892 949 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Mrpl23-207ENSMUST00000210803 590 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm9644-201ENSMUST00000212828 1183 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Tmod3-205ENSMUST00000215821 898 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Fcer1g-201ENSMUST00000079957 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Tmem181c-ps-201ENSMUST00000115772 1288 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gsdmcl2-202ENSMUST00000185391 796 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm43636-201ENSMUST00000201501 2235 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm21986-201ENSMUST00000113671 5560 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm45428-201ENSMUST00000209619 1789 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Perm1Q149B8 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms