Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
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Ttc39dQ0VF76 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Ttc39dQ0VF76 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Ttc39dQ0VF76 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Ttc39dQ0VF76 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Ttc39dQ0VF76 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Ttc39dQ0VF76 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
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Ttc39dQ0VF76 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
Ttc39dQ0VF76 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
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Ttc39dQ0VF76 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ttc39dQ0VF76 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gm5420-201ENSMUST00000071008 2206 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ttc39dQ0VF76 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ttc39dQ0VF76 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
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Ttc39dQ0VF76 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Ccpg1-201ENSMUST00000037977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ttc39dQ0VF76 Anxa7-202ENSMUST00000100844 2904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ttc39dQ0VF76 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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