Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Etv3-201ENSMUST00000117293 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Gjb2Q00977 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Slc17a5-201ENSMUST00000052441 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Cdc42ep4-202ENSMUST00000106616 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Gjb2Q00977 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms