Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm45418-202ENSMUST00000210693 649 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 1700026F02Rik-203ENSMUST00000211950 1082 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 AC134248.1-201ENSMUST00000216113 1176 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
H3f3aP84244 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC9.9□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm5308-201ENSMUST00000196752 1354 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Tox4-201ENSMUST00000022766 5350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm7929-201ENSMUST00000178711 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm3015-202ENSMUST00000179803 624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 AC174678.2-201ENSMUST00000156420 3275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC9.89□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Ikzf2-204ENSMUST00000188110 1365 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Ikzf2-208ENSMUST00000190855 1359 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Miga2-201ENSMUST00000077977 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
H3f3aP84244 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
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