Protein–RNA interactions for Protein: P62301

Rps13, 40S ribosomal protein S13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 151 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps13P62301 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Ddr1-212ENSMUST00000166980 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Rps13P62301 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Rps13P62301 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps13P62301 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps13P62301 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps13P62301 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps13P62301 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps13P62301 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps13P62301 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps13P62301 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps13P62301 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps13P62301 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps13P62301 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps13P62301 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps13P62301 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps13P62301 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps13P62301 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps13P62301 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps13P62301 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Rps13P62301 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms