Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Rdh13-201ENSMUST00000008579 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Kdelc1-201ENSMUST00000027213 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Bach2os-202ENSMUST00000136149 687 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 AC153506.1-201ENSMUST00000218768 2915 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Gm6641-201ENSMUST00000196100 1315 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 1700071K01Rik-201ENSMUST00000117522 819 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 1700123M08Rik-202ENSMUST00000146154 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Vmn2r-ps54-203ENSMUST00000150856 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Gm43912-201ENSMUST00000204352 538 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 D830035M03Rik-201ENSMUST00000213677 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Capsl-202ENSMUST00000226688 739 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Spata46-201ENSMUST00000056991 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 EU599041-202ENSMUST00000205291 1386 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Scarf2P59222 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms