Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Efcab12-201ENSMUST00000032468 2551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Olfr1090-202ENSMUST00000215991 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Lrtm1-203ENSMUST00000224760 3060 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Dph6-201ENSMUST00000028640 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Irf5P56477 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Pex19-202ENSMUST00000111252 2844 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Irf5P56477 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Irf5P56477 2010109P13Rik-201ENSMUST00000204605 392 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
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Irf5P56477 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Irf5P56477 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 AC164161.2-201ENSMUST00000217446 1730 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Irf5P56477 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Sfxn5-201ENSMUST00000045846 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Itga7-202ENSMUST00000218290 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Irf5P56477 Olfr1118-201ENSMUST00000121296 996 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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