Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Kirrel3-205ENSMUST00000187182 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Pear1-216ENSMUST00000174759 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 C530005A16Rik-201ENSMUST00000142815 2436 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Sh3bp1P55194 Synpo2l-203ENSMUST00000119483 3696 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Ppp1r16b-203ENSMUST00000103116 6370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Entpd5-206ENSMUST00000122194 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Bcat1-203ENSMUST00000111742 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Btrc-206ENSMUST00000224102 3037 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Grb10-202ENSMUST00000109653 2048 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 D030028A08Rik-202ENSMUST00000131501 3542 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Adcy4-201ENSMUST00000002398 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gckr-202ENSMUST00000201166 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Odf2-207ENSMUST00000113762 2353 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sh3bp1P55194 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
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