Protein–RNA interactions for Protein: P52194

Clgn, Calmegin, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClgnP52194 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 AC207128.2-201ENSMUST00000223708 1924 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Sh2d3c-202ENSMUST00000113242 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Meox2-201ENSMUST00000041183 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Pnpla3-201ENSMUST00000045289 4640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gria1-201ENSMUST00000036315 5546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Kirrel3-201ENSMUST00000045091 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
ClgnP52194 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms