Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm22291-201ENSMUST00000178027 119 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 n-R5s141-201ENSMUST00000178066 119 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 n-R5s100-201ENSMUST00000178106 119 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 n-R5s111-201ENSMUST00000178203 119 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 n-R5s105-201ENSMUST00000178499 119 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 n-R5s149-201ENSMUST00000178520 119 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 n-R5s103-201ENSMUST00000178755 119 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 n-R5s123-201ENSMUST00000178804 119 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 n-R5s142-201ENSMUST00000178820 119 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 n-R5s144-201ENSMUST00000178859 119 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 n-R5s139-201ENSMUST00000178975 119 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 n-R5s134-201ENSMUST00000178983 119 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 n-R5s136-201ENSMUST00000179080 119 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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Hoxc13P50207 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 AC174797.2-202ENSMUST00000225729 568 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
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Hoxc13P50207 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Hoxc13P50207 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Hoxc13P50207 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
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Hoxc13P50207 9530026P05Rik-204ENSMUST00000204449 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Hoxc13P50207 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Hoxc13P50207 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Hoxc13P50207 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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Hoxc13P50207 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
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