Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Nf2-202ENSMUST00000056290 2394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
VdrP48281 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VdrP48281 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
VdrP48281 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
VdrP48281 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm42683-201ENSMUST00000196136 2328 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
VdrP48281 Nup50-201ENSMUST00000165443 4741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
VdrP48281 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
VdrP48281 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm44286-201ENSMUST00000204098 1487 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gpr149-201ENSMUST00000058535 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
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VdrP48281 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Pear1-201ENSMUST00000029714 4260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
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VdrP48281 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
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VdrP48281 1500004A13Rik-205ENSMUST00000184014 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Itpa-201ENSMUST00000103193 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
VdrP48281 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm24239-201ENSMUST00000157791 255 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
VdrP48281 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms