Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
PrkcdP28867 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Zfp605-202ENSMUST00000112528 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Gm45675-201ENSMUST00000211202 3429 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Prox1-203ENSMUST00000177288 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Rere-202ENSMUST00000105682 7728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Bsdc1-201ENSMUST00000048162 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Cdca2-207ENSMUST00000163100 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Slc16a7-202ENSMUST00000105257 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Atp13a4-201ENSMUST00000039090 2878 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Olfr707-204ENSMUST00000213251 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Trpc6-202ENSMUST00000214596 2913 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Tmem204-202ENSMUST00000153745 902 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
PrkcdP28867 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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