Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm9135-201ENSMUST00000182963 990 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm45410-201ENSMUST00000211331 1093 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Apon-201ENSMUST00000060782 1397 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm4744-201ENSMUST00000073642 792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
RxrgP28705 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Ube2q2-203ENSMUST00000122441 2081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Vcan-202ENSMUST00000109544 5702 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Osr2-204ENSMUST00000228152 1324 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Zfp667-204ENSMUST00000153840 596 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
RxrgP28705 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
RxrgP28705 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms