Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Ank3-204ENSMUST00000092432 5832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
RxraP28700 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RxraP28700 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RxraP28700 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RxraP28700 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
RxraP28700 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RxraP28700 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
RxraP28700 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Csrp2-203ENSMUST00000219502 544 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
RxraP28700 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 B9d1os-201ENSMUST00000137010 674 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 1600002K03Rik-201ENSMUST00000041882 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
RxraP28700 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
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