Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Ggta1P23336 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Bbs5-202ENSMUST00000112286 1397 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Fbxo43-201ENSMUST00000058643 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm4917-201ENSMUST00000121452 650 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Bicral-201ENSMUST00000040624 6579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Ggta1P23336 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms