Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
P18529 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Tsc22d4-202ENSMUST00000100539 3983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Tpx2-206ENSMUST00000164120 4365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Gm12856-201ENSMUST00000119471 1293 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Gm37986-201ENSMUST00000193285 383 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
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P18529 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Ppp1r26-201ENSMUST00000040324 5466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Shroom2-201ENSMUST00000062317 6997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Ccdc93-201ENSMUST00000036025 7274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.94
P18529 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
P18529 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
P18529 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
P18529 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
P18529 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
P18529 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC9.15□□□□□ -0.95
P18529 Ralgps1-201ENSMUST00000042615 6029 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
P18529 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
P18529 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
P18529 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.95
P18529 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.15□□□□□ -0.95
P18529 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18529 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18529 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18529 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18529 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18529 Atxn2l-206ENSMUST00000206577 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18529 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18529 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.95
P18529 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC9.14□□□□□ -0.95
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