Protein–RNA interactions for Protein: P17208

Pou4f1, POU domain, class 4, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f1P17208 Clasp2-201ENSMUST00000111838 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Styx-205ENSMUST00000226873 12974 ntAPPRIS P1 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Pou4f1P17208 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms