Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 AC134898.1-201ENSMUST00000223738 1836 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Trip12-207ENSMUST00000186648 6442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Rho-201ENSMUST00000032471 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm26809-201ENSMUST00000180863 2981 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Dcc-201ENSMUST00000073379 4855 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Adamts13-202ENSMUST00000102891 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Hsd3b5-201ENSMUST00000044094 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Acad10-202ENSMUST00000111770 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm10031-201ENSMUST00000190422 2653 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Parp10-201ENSMUST00000075689 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Nav2-202ENSMUST00000064395 11317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Slc25a44-204ENSMUST00000195657 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 F730016J06Rik-203ENSMUST00000156508 2593 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Mov10-203ENSMUST00000106775 3584 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Mov10-206ENSMUST00000166979 3584 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Slc1a7-201ENSMUST00000106713 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Traf7-215ENSMUST00000176652 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Vps13b-201ENSMUST00000048646 13757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Myo16-202ENSMUST00000207204 6719 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gpr156-201ENSMUST00000061274 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Nsd2-201ENSMUST00000058096 4633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Dpysl4-201ENSMUST00000026551 3552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Rorc-201ENSMUST00000029795 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Tet3-202ENSMUST00000089622 10904 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Hdac7-204ENSMUST00000116409 4113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 L3mbtl3-201ENSMUST00000040219 4572 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Dlgap4-206ENSMUST00000109568 3256 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Sycp2l-201ENSMUST00000124093 2641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ephb4-205ENSMUST00000166239 3741 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Gm44531-201ENSMUST00000208364 2000 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Mc4r-201ENSMUST00000057942 2758 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 Slc2a1-201ENSMUST00000030398 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
Vpreb1P13372 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms