Protein–RNA interactions for Protein: P04213

T-cell receptor beta chain V region C5 (Fragment), mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04213 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Oplah-201ENSMUST00000023222 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Pias2-203ENSMUST00000168882 4984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Klhl29-202ENSMUST00000218384 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
P04213 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Anxa9-204ENSMUST00000164406 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Avil-201ENSMUST00000026500 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Hmg20a-206ENSMUST00000217518 2468 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
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P04213 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 AW549877-201ENSMUST00000046633 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
P04213 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
P04213 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P04213 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
P04213 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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