Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Npepps-201ENSMUST00000001480 4215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Ap5s1-201ENSMUST00000089506 1432 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm16165-201ENSMUST00000160140 795 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm24809-201ENSMUST00000175318 271 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm4604-201ENSMUST00000025040 390 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm15935-201ENSMUST00000141004 607 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Ins2-208ENSMUST00000162317 297 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Gm26670-202ENSMUST00000226862 340 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Olfr538-201ENSMUST00000084457 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
XntrpcF8VQM8 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms