Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Gm25562-201ENSMUST00000104608 133 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Cenpx-203ENSMUST00000106154 873 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Rbmx2-ps-201ENSMUST00000119377 930 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Btg4-203ENSMUST00000213680 1282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Cwc25-202ENSMUST00000107579 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Slc25a17-201ENSMUST00000023040 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Sfxn5-204ENSMUST00000113788 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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PtprsB0V2N1 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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PtprsB0V2N1 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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PtprsB0V2N1 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PtprsB0V2N1 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
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