Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Ctso-201ENSMUST00000029649 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Mcf2-204ENSMUST00000228150 3336 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm1627-201ENSMUST00000188504 2588 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm10425-201ENSMUST00000181085 3364 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Arhgap17-202ENSMUST00000106442 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Skiv2l-201ENSMUST00000046022 3951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Fam161a-201ENSMUST00000058269 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 St5-201ENSMUST00000077909 4612 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Parp1-201ENSMUST00000027777 3873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Llgl1-202ENSMUST00000108719 4268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Samt1A2BED8 Sh2d7-201ENSMUST00000060242 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
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Samt1A2BED8 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gria4-202ENSMUST00000063508 5352 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Ppp6r2-201ENSMUST00000088788 2887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Dlgap2-208ENSMUST00000150247 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Tm4sf1-201ENSMUST00000029376 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Fam222b-203ENSMUST00000155571 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
Samt1A2BED8 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
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