Protein–RNA interactions for Protein: A2AH22

Ambra1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ambra1A2AH22 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 4930447F24Rik-201ENSMUST00000194140 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Olfr1372-ps1-201ENSMUST00000121007 934 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Muc2-202ENSMUST00000167366 711 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm28916-201ENSMUST00000186988 699 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm29669-201ENSMUST00000188605 881 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm29328-212ENSMUST00000209182 1168 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm18124-201ENSMUST00000210695 706 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Cdc42-202ENSMUST00000051477 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 4930529I22Rik-201ENSMUST00000131509 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm11670-201ENSMUST00000143435 511 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Mir7088-201ENSMUST00000184227 86 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Ckb-ps2-201ENSMUST00000198886 1001 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm18466-201ENSMUST00000209147 499 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm6304-201ENSMUST00000096579 447 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Eddm3b-201ENSMUST00000100645 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Fkbp6-201ENSMUST00000044972 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm15599-201ENSMUST00000122283 1345 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Cpvl-202ENSMUST00000203101 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ambra1A2AH22 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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