Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Snx29-201ENSMUST00000096273 1622 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lgr5Q9Z1P4 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm6612-201ENSMUST00000170777 395 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm5808-201ENSMUST00000178090 357 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 AC154213.1-201ENSMUST00000228234 583 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm8420-201ENSMUST00000097103 598 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Tcstv1-201ENSMUST00000178510 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 4930486N12Rik-201ENSMUST00000206668 632 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm45527-201ENSMUST00000211052 774 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Nsmce2-203ENSMUST00000227173 1122 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm9507-201ENSMUST00000095491 877 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Npr2-202ENSMUST00000107874 3480 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Eef1b2-204ENSMUST00000129339 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Hsd3b1-202ENSMUST00000107016 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lgr5Q9Z1P4 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms