Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm9843-201ENSMUST00000052867 504 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Cxcr2-201ENSMUST00000027372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Elmo2-201ENSMUST00000071699 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Skp2-201ENSMUST00000096482 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Dopey2-207ENSMUST00000227156 7340 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Igf1-206ENSMUST00000122100 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm15395-201ENSMUST00000153724 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Tubgcp5-205ENSMUST00000205796 3448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Manea-201ENSMUST00000041374 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Lmo3-207ENSMUST00000163065 2425 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Nfkbiz-201ENSMUST00000036273 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm17058-201ENSMUST00000168951 928 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Blvrb-201ENSMUST00000037399 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Tubb5-201ENSMUST00000001566 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Cct8l1-201ENSMUST00000045016 1961 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
ChmQ9QXG2 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms