Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Lhx9-202ENSMUST00000046870 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Impa1-202ENSMUST00000118410 2988 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr624-201ENSMUST00000062144 5731 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 AC140293.1-201ENSMUST00000225626 1247 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Dffa-201ENSMUST00000030816 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Bdh1-203ENSMUST00000115227 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Apobec3-205ENSMUST00000175752 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Anks1b-218ENSMUST00000182595 3715 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Rabgef1Q9JM13 Gm28268-201ENSMUST00000188966 2528 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
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