Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 AC134860.2-201ENSMUST00000225277 1036 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 C330021F23Rik-201ENSMUST00000086479 1111 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm5244-201ENSMUST00000164001 339 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 AC116680.1-201ENSMUST00000222804 613 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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OtofQ9ESF1 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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OtofQ9ESF1 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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OtofQ9ESF1 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gab3-202ENSMUST00000114104 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
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OtofQ9ESF1 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm5764-201ENSMUST00000118817 885 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm44498-201ENSMUST00000199509 111 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Hsd3b3-204ENSMUST00000107019 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
OtofQ9ESF1 Gm7168-201ENSMUST00000088809 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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