Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Fgl2-201ENSMUST00000035799 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Rassf4-201ENSMUST00000035842 6460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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MesdQ9ERE7 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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MesdQ9ERE7 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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MesdQ9ERE7 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Rsg1-201ENSMUST00000097813 985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
MesdQ9ERE7 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
MesdQ9ERE7 Pcsk9-201ENSMUST00000049507 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
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