Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Med27Q9DB40 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Nmt1-201ENSMUST00000021314 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Wdr13-201ENSMUST00000033506 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm14398-201ENSMUST00000117287 1073 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Med27Q9DB40 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms