Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 4933401J01Rik-201ENSMUST00000193812 1070 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 4933402C05Rik-201ENSMUST00000208189 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Smco1-201ENSMUST00000093183 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Lrrc8a-201ENSMUST00000095078 4301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Higd1c-201ENSMUST00000175683 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Vps16-201ENSMUST00000028900 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Ipo4-201ENSMUST00000047131 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
PrameQ9D4Z5 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms