Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Use1Q9CQ56 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Use1Q9CQ56 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Use1Q9CQ56 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Use1Q9CQ56 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Use1Q9CQ56 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Use1Q9CQ56 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Use1Q9CQ56 Gtf2i-219ENSMUST00000174155 4141 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
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Use1Q9CQ56 Kpna7-202ENSMUST00000110673 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Use1Q9CQ56 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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Use1Q9CQ56 Peg3-201ENSMUST00000051209 8694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Dhx34-204ENSMUST00000121123 3880 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Use1Q9CQ56 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms