Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Gm12337-201ENSMUST00000119634 400 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Krtap3-3-201ENSMUST00000092700 736 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Psmc1-201ENSMUST00000021595 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Rpsa-ps5-201ENSMUST00000121462 885 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 CT030195.2-201ENSMUST00000226074 1286 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Rps3a2-201ENSMUST00000074245 792 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Rps3a3-201ENSMUST00000074680 795 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Atg3Q9CPX6 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms