Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 H2-M10.1-201ENSMUST00000025322 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Mir133a-1hg-201ENSMUST00000179771 395 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Tprg-201ENSMUST00000056087 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Atp1b4Q99ME6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Mir6973a-201ENSMUST00000183646 78 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Vcp-rs-201ENSMUST00000120233 2406 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gcg-201ENSMUST00000102733 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm15707-201ENSMUST00000118804 996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 C330021F23Rik-204ENSMUST00000151633 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm12426-201ENSMUST00000153083 371 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Atp1b4Q99ME6 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms