Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Mtmr11-201ENSMUST00000054356 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Akap12-202ENSMUST00000215696 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm25226-201ENSMUST00000158198 123 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm15271-201ENSMUST00000134627 2110 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Satb1-204ENSMUST00000133574 3461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Mical2-202ENSMUST00000050149 6669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Pde4c-202ENSMUST00000110095 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Zfp827-203ENSMUST00000119254 4549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Atcayos-203ENSMUST00000150782 3057 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm17151-201ENSMUST00000105760 367 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Ubxn4Q8VCH8 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.2 ms