Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Unk-201ENSMUST00000021116 3735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Trappc12Q8K2L8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Trappc12Q8K2L8 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Trappc12Q8K2L8 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Trappc12Q8K2L8 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Trappc12Q8K2L8 Gm28356-201ENSMUST00000186941 927 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Trappc12Q8K2L8 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Trappc12Q8K2L8 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc12Q8K2L8 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc12Q8K2L8 Gm13954-201ENSMUST00000123441 543 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Trappc12Q8K2L8 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc12Q8K2L8 Gm37921-201ENSMUST00000194333 695 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
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Trappc12Q8K2L8 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc12Q8K2L8 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc12Q8K2L8 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Trappc12Q8K2L8 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms